Phenotypical and Genotypical Comparison of Clostridium difficile Isolated from Clinical Samples: Homebrew DNA Fingerprinting versus Antibiotic Susceptibility Testing (AST) and Clostridial Toxin Genes

Table 3

Distribution of toxigenic profile of comparison isolates together with antibiotic susceptibility.

Pulsotype	Toxigenic profile genes				Antibiotic susceptibility
	tcdA	tcdB	cdtA	cdtB	Van	Mtz	Rif
A1	+	−	−	−	S	S	S
A2	+	−	−	−	S	S	S
B1	+	+	−	−	S	S	S
B2	+	+	−	−	S	S	S
C1	+	+	−	−	R	S	S
C2	+	+	−	−	R	R	S
D	+	+	−	−	S	S	S
E1	+	+	−	−	S	S	S
E2	+	+	−	−	S	S	S
F1	+	+	+	+	S	S	S
F2	+	+	+	+	S	S	S
F3	+	+	+	+	S	S	S
G1	+	+	−	−	S	S	S
G2	+	+	−	−	S	S	S
H1	+	+	−	−	S	S	S
H2	+	+	−	−	S	S	S
I1	+	+	−	−	S	S	S
I2	+	+	−	−	S	S	S
J1	+	+	−	−	S	S	S
J2	+	+	−	−	S	S	S
K1	+	+	−	−	R	S	S
K2	+	+	−	−	R	R	S

Van: vancomycin, Mtz: metronidazole, and Rif: rifampicin.